Laboratoire imagerie de l’infection et de l’immunité (L3i)
Le Laboratoire imagerie de l’infection et de l’immunité (L3i) développe des protocoles d’imagerie optique et nucléaire pour visualiser les maladies en temps réel. Ces approches permettent de suivre de l’échelle moléculaire jusqu’au corps entier la dynamique de dissémination des pathogènes, la biodistribution de candidats vaccins ou traitements ainsi que la réponse immunitaire dans des modèles de maladies infectieuses et auto-immunes humaines.
Visualiser l’infection de la molécule au corps entier
Thématiques de recherche
La caractérisation des tissus au niveau cellulaire et moléculaire au cours des maladies infectieuses et auto-immune est un enjeu majeur pour mieux comprendre les mécanismes globaux de ces pathologies. Le laboratoire L3i développe ainsi des stratégies de caractérisation du microenvironnement immunitaire et infectieux à l’aide d’outils histologiques et de multiplexage avancé.
PI : Q. Pascal (CEA)
L’étude de la biodistribution des nouvelles stratégies thérapeutiques et vaccinales est un enjeu majeur dans l’évaluation de leur efficacité et de leur innocuité. Nous développons ainsi des approches permettant le suivi, à l’échelle locale ou du corps entier, de la cinétique de distribution de ces molécules thérapeutiques ou vaccinales. Ces protocoles d’imagerie permettent ainsi par exemple de déterminer quelle voie d’administration est la plus adaptée à la distribution du médicament ou du vaccin souhaitée.
PI : T. Naninck (CEA)
Le laboratoire L3i met en œuvre des stratégies d’imagerie optique et nucléaire permettant de détecter à différentes échelles, microscopique et macroscopique, la biodistribution de pathogènes donnés, leur persistance éventuelle à moyen et long terme. Cela a été mis en évidence pour visualiser par exemple la distribution et la persistance du SARS-CoV-2 dans l’ensemble de l’organisme mais aussi pour d’autres virus ou bactéries d’intérêt. En complément, nous développons des protocoles d’imagerie permettant de visualiser et de quantifier la réponse immunitaire associée, locale ou systémique, au cours du temps.
PI : T. Naninck, C. Mayet (CEA)
Technologies
Scanner et tomographie par émission de positrons
Le scanner, ou tomodensitométrie à rayons X, permet l’évaluation en 3D de la morphologie et de la densité des constituants de l’organisme. Cette technologie peut être couplée à la Tomographie par émission de positrons (TEP) qui a pour objectif de détecter de manière quantitative la distribution d’un composé radioactif, ou radiotraceur, injecté in vivo. En fonction du traceur utilisé, plusieurs informations fonctionnelles, telles que le métabolisme cellulaire, la distribution d’un médicament et la cartographie de cellules ou de pathogènes d’intérêt, peuvent ainsi être obtenues.
Scanner et tomographie par émission de positrons
Le scanner, ou tomodensitométrie à rayons X, permet l’évaluation en 3D de la morphologie et de la densité des constituants de l’organisme. Cette technologie peut être couplée à la Tomographie par émission de positrons (TEP) qui a pour objectif de détecter de manière quantitative la distribution d’un composé radioactif, ou radiotraceur, injecté in vivo. En fonction du traceur utilisé, plusieurs informations fonctionnelles, telles que le métabolisme cellulaire, la distribution d’un médicament et la cartographie de cellules ou de pathogènes d’intérêt, peuvent ainsi être obtenues.
Scanner et tomographie par émission de positrons
Le scanner, ou tomodensitométrie à rayons X, permet l’évaluation en 3D de la morphologie et de la densité des constituants de l’organisme. Cette technologie peut être couplée à la Tomographie par émission de positrons (TEP) qui a pour objectif de détecter de manière quantitative la distribution d’un composé radioactif, ou radiotraceur, injecté in vivo. En fonction du traceur utilisé, plusieurs informations fonctionnelles, telles que le métabolisme cellulaire, la distribution d’un médicament et la cartographie de cellules ou de pathogènes d’intérêt, peuvent ainsi être obtenues.
Scanner et tomographie par émission de positrons
En savoir plus
Le scanner, ou tomodensitométrie à rayons X, permet l’évaluation en 3D de la morphologie et de la densité des constituants de l’organisme. Cette technologie peut être couplée à la Tomographie par émission de positrons (TEP) qui a pour objectif de détecter de manière quantitative la distribution d’un composé radioactif, ou radiotraceur, injecté in vivo. En fonction du traceur utilisé, plusieurs informations fonctionnelles, telles que le métabolisme cellulaire, la distribution d’un médicament et la cartographie de cellules ou de pathogènes d’intérêt, peuvent ainsi être obtenues.
Scanner et tomographie par émission de positrons
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Le scanner, ou tomodensitométrie à rayons X, permet l’évaluation en 3D de la morphologie et de la densité des constituants de l’organisme. Cette technologie peut être couplée à la Tomographie par émission de positrons (TEP) qui a pour objectif de détecter de manière quantitative la distribution d’un composé radioactif, ou radiotraceur, injecté in vivo. En fonction du traceur utilisé, plusieurs informations fonctionnelles, telles que le métabolisme cellulaire, la distribution d’un médicament et la cartographie de cellules ou de pathogènes d’intérêt, peuvent ainsi être obtenues.
Scanner et tomographie par émission de positrons
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Le scanner, ou tomodensitométrie à rayons X, permet l’évaluation en 3D de la morphologie et de la densité des constituants de l’organisme. Cette technologie peut être couplée à la Tomographie par émission de positrons (TEP) qui a pour objectif de détecter de manière quantitative la distribution d’un composé radioactif, ou radiotraceur, injecté in vivo. En fonction du traceur utilisé, plusieurs informations fonctionnelles, telles que le métabolisme cellulaire, la distribution d’un médicament et la cartographie de cellules ou de pathogènes d’intérêt, peuvent ainsi être obtenues.
Microscopie optique in vitro et in vivo
+
Le laboratoire L3i possède une diversité d’instruments d’imagerie optique permettant la détection in vitro ou in vivo de composés fluorescents d’intérêt, comme les cellules, pathogènes et molécules, de l’échelle macroscopique à l’échelle subcellulaire.
Microscopie optique in vitro et in vivo
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Le laboratoire L3i possède une diversité d’instruments d’imagerie optique permettant la détection in vitro ou in vivo de composés fluorescents d’intérêt, comme les cellules, pathogènes et molécules, de l’échelle macroscopique à l’échelle subcellulaire.
Microscopie optique in vitro et in vivo
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Le laboratoire L3i possède une diversité d’instruments d’imagerie optique permettant la détection in vitro ou in vivo de composés fluorescents d’intérêt, comme les cellules, pathogènes et molécules, de l’échelle macroscopique à l’échelle subcellulaire.
Technologie
Microscopie optique in vitro et in vivo
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Le laboratoire L3i possède une diversité d’instruments d’imagerie optique permettant la détection in vitro ou in vivo de composés fluorescents d’intérêt, comme les cellules, pathogènes et molécules, de l’échelle macroscopique à l’échelle subcellulaire.
Technologie
Microscopie optique in vitro et in vivo
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Le laboratoire L3i possède une diversité d’instruments d’imagerie optique permettant la détection in vitro ou in vivo de composés fluorescents d’intérêt, comme les cellules, pathogènes et molécules, de l’échelle macroscopique à l’échelle subcellulaire.
Technologie
Histologie et multiplexage tissulaire
Le laboratoire L3i possède un plateau technique d’histologie permettant la génération, la coloration et le marquage (jusqu’à 40 marquages par lame) de coupes tissulaires ou d’échantillons cellulaires. Une expertise en anatomopathologie est également proposée.
Thibaut Nanink
Ingénieur-chercheur CEA, docteur en immunologie avec un double diplôme d’ingénieur en biologie et biotechnologie (Ecole polytechnique, AgroParisTech), Thibaut Naninck coordonne l’ensemble des activités du L3i depuis 2023, après avoir participé au déploiement de l’activité d’imagerie TEP dès 2018.
Membre de la Société européenne d’imagerie moléculaire, il consacre ses projets de recherche à l’imagerie des pathogènes et des réponses immunes dans les modèles précliniques de maladies infectieuses humaines.
Thibault Naninck
Ingénieur-chercheur CEA, docteur en immunologie avec un double diplôme d’ingénieur en biologie et biotechnologie (Ecole polytechnique, AgroParisTech), Thibaut Naninck coordonne l’ensemble des activités du L3i depuis 2023, après avoir participé au déploiement de l’activité d’imagerie TEP dès 2018.
Membre de la Société européenne d’imagerie moléculaire, il consacre ses projets de recherche à l’imagerie des pathogènes et des réponses immunes dans les modèles précliniques de maladies infectieuses humaines.
Quelques publications
Pinaud M., Zamborlini A. (2025). Electroporation-based CRISPR-Cas9-mediated gene knockout in THP-1 cells and single-cell clone isolation. J Vis Exp, 216. Lire.
Reot L., Adapen C., Cannou C., Nunez N., Lakoum S., Pimienta C., Lacroix L., Binois O., Frydman N., Nugeyre M.-T., Le Grand R., Menu E. (2024). Seminal plasma inhibits Chlamydia trachomatis infection in vitro, and may have consequences on mucosal immunity. Sci Rep, 14(1):21050. Lire.
Mantel N., Piras-Douce F., Chautard E., Marcos-Lopez E., Bodinham C.L., Cosma A., Courtois V., Dhooge N., Gautheron S., Kaufmann S.H.E., Pizzoferro K., Lewis D.J.M., Martinon F., Pagnon A., Raynal F., Dereuddre-Bosquet N., Le Grand R. (2024). Cynomolgus macaques as a translational model of human immune responses to yellow fever 17D vaccination. J Virol, 98(5):e0151623. Lire.
Passaes C., Desjardins D., Chapel A., Monceaux V., Lemaitre J., Mélard A., Perdomo-Celis F., Planchais C., Gourvès M., Dimant N., David A., Dereuddre-Bosquet N., Barrail-Tran A., Gouget H., Guillaume C., Relouzat F., Lambotte O., Guedj J., Müller-Trutwin M., Mouquet H., Rouzioux C., Avettand-Fenoël V., Le Grand R., Sáez-Cirión A. (2024). Early antiretroviral therapy favors post-treatment SIV control associated with the expansion of enhanced memory CD8+ T-cells. Nat Commun, 15(1):178. Lire.
Suphaphiphat K., Desjardins D., Lorin V., Dimant N., Bouchemal K., Bossevot L., Galpin-Lebreau M., Dereuddre-Bosquet N., Mouquet H., Le Grand R., Cavarelli M. (2023). Mucosal application of the broadly neutralizing antibody 10-1074 protects macaques from cell-associated SHIV vaginal exposure. Nat Commun, 14(1):6224. Lire.
Rousseau A., Haigh O., Le Grand R., Palgen J.-L., Lemaitre J., Deback C., Oziol N., Lomonte P., Labetoulle M. (2022). Initial TK-deficient HSV-1 infection in the lip alters contralateral lip challenge immune dynamics. Sci Rep, 12(1):8489. Lire.
Van Tilbeurgh M., Maisonnasse P., Palgen J.-L., Tolazzi M., Aldon Y., Dereuddre-Bosquet N., Cavarelli M., Beignon A.-S., Marcos-Lopez E., Gallouet A.-S., Gilson E., Ozorowski G., Ward A.B., Bontjer I., McKay P.F., Shattock R.J., Scarlatti G., Sanders R.W., Le Grand R. (2022). Innate cell markers that predict anti-HIV neutralizing antibody titers in vaccinated macaques. Cell Rep Med, 3(10):100751. Lire.
Fovet C.-M., Pimienta C., Galhaut M., Relouzat F., Nunez N., Cavarelli M., Sconosciuti Q., Dhooge N., Marzinotto I., Lampasona V., Tolazzi M., Scarlatti G., Ho Tsong Fang R., Naninck T., Dereuddre-Bosquet N., Van Wassenhove J., Gallouët A.-S., Maisonnasse P., Le Grand R., Menu E., Seddiki N. (2022). A case study to dissect immunity to SARS-CoV-2 in a neonate nonhuman primate model. Front Immunol, 13:855230. Lire.
Adapen C., Réot L., Nunez N., Cannou C., Marlin R., Lemaître J., d’Agata L., Gilson E., Ginoux E., Le Grand R., Nugeyre M.-T., Menu E. (2022). Local innate markers and vaginal microbiota composition are influenced by hormonal cycle phases. Front Immunol, 13:841723. Lire.
Palgen J.-L., Tchitchek N., Rodriguez-Pozo A., Jouhault Q., Abdelhouahab H., Dereuddre-Bosquet N., Contreras V., Martinon F., Cosma A., Lévy Y., Le Grand R., Beignon A.-S. (2020). Innate and secondary humoral responses are improved by increasing the time between MVA vaccine immunizations. NPJ Vaccines, 5(1):24. Lire.
